권도훈 연구실

본 연구는 애기장대 ClpS1 단백질의 N-degron 특이성을 규명하기 위해 2.0 Å 해상도의 구조를 결정했습니다. 박테리아 ClpS는 Leu과 Phe N-degron을 선호하지만, 식물 ClpS1은 Phe과 Trp에 강하게 결합하고 Leu에만 약하게 결합합니다. α3-helix의 단축과 Val에서 Ala로의 아미노산 치환으로 인한 소수성 상호작용 감소가 이러한 선택성 차이를 야기합니다.

본 연구는 SRC-1 선택적 결합제와 UBR box 리간드를 연결한 PROTAC을 개발하여 N-degron 경로를 통해 SRC-1을 효율적으로 분해합니다. 개발된 SRC-1 분해제는 암세포의 침입과 이동을 체외 및 생체 내에서 유의하게 억제합니다. 이 연구는 N-degron 경로 기반 PROTAC이 질병 관련 단백질 분해의 광범위한 전략임을 시사합니다.

본 연구는 자동포식 과정에서 SQSTM1/p62의 이중 역할을 규명합니다. SQSTM1의 ZZ 도메인이 Arg-charged N-degron을 인식하는 N-recognin으로 작용하며, pH 의존적 PB1 도메인 올리고머화를 통해 다양한 N-degron과의 상호작용이 조절됩니다. 세포 pH 변화에 따른 SQSTM1 올리고머화의 pH 의존적 조절이 자동포식 과정과 밀접하게 연결되어 있습니다.

본 연구는 Legionella pneumophila의 효소 단백질 RavZ가 파고포어 막의 LC3를 절단하는 분자 메커니즘을 규명합니다. RavZ와 LC3의 1:2 복합체 구조 분석을 통해 LC3 상호작용 영역(LIR) 모티프를 포함한 N- 및 C-말단 영역이 기질 인식에 중요함을 밝혔습니다.