이세민 연구실

본 연구는 250명의 대상자(건강한 대조군 100명, 치주염 환자 150명)의 타액 샘플에서 16S rRNA 유전자 시퀀싱을 수행하여 치주 건강과 다양한 단계의 치주염을 분류할 수 있는 미생물 구성을 특성화했습니다. 무작위 숲 머신러닝 모델을 사용하여 차등 풍부 분류군을 기반으로 각 치주염 단계를 분류한 결과, 다중 치주염 상태 분류에서 AUC 0.829, 민감도 0.884, 특이도 0.652를 달성했으며, 건강한 개인과 치주염 환자 구분에서는 AUC 0.924의 높은 진단 정확도를 보였습니다.

본 연구는 RNA-seq 데이터에서 체세포 단일염기변이(sSNV)를 정확하게 검출하기 위한 RNA-MosaicHunter 도구를 개발했습니다. 벤치마킹 데이터셋에서 94.7~99.3%의 높은 정밀도를 보였으며, GTEx 프로젝트의 827개 샘플 분석과 알츠하이머병 뇌 샘플 382개 분석을 통해 정상 노화 및 질병 관련 sSNV 특성을 규명했습니다.

본 연구는 망막변성질환 모델 마우스에서 세포투과성 siRNA를 이용한 RORB 일시적 억제가 광수용체 생존을 개선하고 시각 기능을 보존함을 입증합니다. 체외 실험에서 RORB 억제는 단백질독성 스트레스 하에서 세포 생존력을 향상시키고 세포자멸사를 감소시켰으며, 생체 내 실험에서 망막 RORB 발현 감소로 광수용체 생존 및 시각 기능이 개선되었습니다. 단일세포 RNA 시퀀싱 결과 프로테아솜 소단위 유전자의 상향조절을 확인하여 단백질 항상성 개선을 시사합니다.

본 연구는 차세대 염기서열 분석을 이용하여 엑소좀 유래 소형 RNA를 분석하였으며, 췌장암 진행 및 예후와 관련된 잠재적 바이오마커를 규명하였습니다. 이러한 바이오마커는 췌장암의 주요 분자적 변화를 반영하며 질병 모니터링을 위한 임상적으로 유용한 바이오마커로 활용될 수 있습니다.

본 연구는 NRL을 표적하는 세포투과성 siRNA(cp-asiNRL)를 망막변성질환 마우스 모델에 유리체내 투여하여 막대세포에서 원뿔세포로의 전환을 유도하고 망막변성을 완화하는 치료 가능성을 조사합니다. cp-asiNRL은 NRL 발현을 억제하고 원뿔세포 마커 발현을 증가시켜 정상 및 신생혈관성 황반변성 모델에서 망막 기능을 개선했습니다. 단일세포 RNA 시퀀싱 결과 막대세포에서 원뿔세포 유사 세포로의 전환이 확인되어, NRL 침묵화가 망막변성질환의 새로운 치료 전략으로 가능성을 보입니다.